当センターは，センター長，及び3部門9分野で構成されています。
- 原虫病研究センター
センター長
創薬研究部門 先端治療学分野
診断治療研究部門 高度診断学分野
診断治療研究部門 先端予防治療学分野
診断治療研究部門 感染病理学分野
国際連携協力部門 国際獣疫学分野
国際連携協力部門 国際協力分野
国際連携協力部門 地球規模感染症学分野
特任研究員（外国人客員研究員）
Oriel Thekisoe
生命平衡科学講座(白寿) (Bio-Self-Regulating Science Laboratory)
教 授 井上 昇（兼任） Prof. Noboru INOUE (Concurrent)
客員教授 原川 信二 Visiting Prof. Shinji HARAKAWA
客員教授（五十音順・敬称略）
五十嵐 郁男 帯広畜産大学 名誉教授
加藤 健太郎 東北大学大学院農学研究科 教授
金子 修 長崎大学熱帯医学研究所 教授
狩野 繁之 国立研究開発法人国立国際医療研究センター研究所熱帯医学・マラリア研究部 部長
北 潔 長崎大学大学院熱帯医学・グローバルヘルス研究科長 教授
鈴木 宏志 帯広畜産大学 名誉教授
辻 尚利 北里大学医学部 教授
濱野 真二郎 長崎大学熱帯医学研究所 教授
藤﨑 幸藏 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 フェロー
堀井 俊宏 大阪大学微生物病研究所マラリア・ワクチン開発寄附研究部門 教授
DeMar Taylor 筑波大学 名誉教授
特任研究員
Thillaiampalam Sivakumar
Maria Angenica Fulo Regilme
Nanang Rudianto Ariefta
Lee Jae Seung
JSPS外国人特別研究員
Macalanda Adrian Miki Cular
事務室
技術補佐員 幅口 剛, 柳原 真波
事務補佐員 鹿又 由江，鈴木 希，山本 由美子
原虫病研究センター運営委員会（五十音順・敬称略）
狩野 繁之 国立国際医療研究センター研究所熱帯医学・マラリア研究部 部長
川口 寧 東京大学医科学研究所 教授
釘田 博文 WOAHアジア太平洋地域事務所 代表
鈴木 定彦 北海道大学人獣共通感染症国際共同研究所 教授
野中 成晃 北海道大学大学院獣医学研究院 教授
Badgar Battsetseg モンゴル獣医学研究所 教授
平山 謙二 長崎大学大学院熱帯医学・グローバルヘルス研究科 教授
堀井 俊宏 大阪大学微生物病研究所 教授
堀本 泰介 東京大学大学院農学生命科学研究科 教授
令和6年度 共同研究員（五十音順・敬称略）
荒木 球沙 国立感染症研究所 非常勤研究員
筏井 宏実 北里大学 教授
池原 譲 千葉大学 教授
石﨑 隆弘 酪農学園大学 講師
笠井 俊二 元エーザイ株式会社 研究員
兼子 裕規 浜松医科大学 教授
川合 覚 獨協医科大学 教授
小柴 琢己 福岡大学 教授
佐藤 梢 国立感染症研究所 流動研究員
杉 達紀 北海道大学 助教
鈴木 丈詞 東京農工大学 教授
田仲 哲也 東北大学 教授
中尾 洋一 早稲田大学 教授
中尾 亮 北海道大学 准教授
錦織 充広 福岡大学 助教
二瓶 浩一 微化研 上級研究員
長谷 耕二 慶應義塾大学 教授
彦坂 健児 千葉大学 准教授
藤田 秋一 鹿児島大学 教授
古谷 哲也 東京農工大学 教授
正谷 達謄 岐阜大学 准教授
宮崎 真也 長崎大学 助教
村田 敏拓 東北医科薬科大学 准教授
守屋 歩 株式会社ホクドー 主任研究員
山岸 潤也 北海道大学 教授
吉川 泰永 北里大学 准教授
Albert Mulenga : Texas A&M University Veterinary, Professor
Apinya Arnuphapprasert: Rajamangala University of Technology Srivijaya, Senior Assistant Professor
Badgar Battsetseg : Mongolian University of Life Science Institute of Veterinary Medicine, Director
Batdorj Davaasuren : Mongolian University of Life Science Institute of Veterinary Medicine, Researcher
Berdikulov Atabek: Kyrgyz Research Institute of Veterinary Named After A. Duisheev, Researcher
Consuelo Almazán: Autonomous University of Queretaro, Adjunct Professor
Daniel Sojka :Biology Centre CAS Institute of Parasitology, Research Scientist
Elisha Chatanga : Lilongwe University of Agriculture and Natural Resources, Lecturer and Researcher
Jinlin Zhou : Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Department of Parasitology, Professor
Kishor Pandey : Tribhuvan University, Associate Professor
Liqing Ma: Qinghai Academy of Animal Sciences and Veterinary Medicine, Qinghai University, Professor
Ruenruetai Udonsom: Mahidol University Faculty of Tropical Medicine, Senior professional scientist
Sanjay Kumar : ICAR-National Research Centre on Equines, India, Principal Scientist