当センターは，センター長，及び3部門7分野で構成されています。
センター長
創薬研究部門 先端治療学分野
診断治療研究部門 高度診断学分野
診断治療研究部門 先端予防治療学分野
診断治療研究部門 感染病理学分野
国際連携協力部門 国際獣疫分野
国際連携協力部門 国際協力分野
国際連携協力部門 地球規模感染症学分野
特任研究員（外国人客員研究員）
Batdorj Davaasuren
生命平衡科学講座(白寿) (Bio-Self-Regulating Science Laboratory)
教 授 井上 昇（兼任） Prof. Noboru INOUE (Concurrent)
客員教授 原川 信二 Visiting Prof. Shinji HARAKAWA
客員教授（五十音順・敬称略）
五十嵐 郁男 帯広畜産大学 名誉教授
加藤 健太郎 東北大学大学院農学研究科 教授
金子 修 長崎大学熱帯医学研究所 教授
狩野 繁之 国立国際医療研究所熱帯医学・マラリア研究部 部長
北 潔 長崎大学大学院熱帯医学・グローバルヘルス研究科長 教授
鈴木 宏志 帯広畜産大学 名誉教授
辻 尚利 北里大学医学部 教授
濱野 真二郎 長崎大学熱帯医学研究所 教授
堀井 俊宏 大阪大学微生物病研究所マラリア・ワクチン開発寄附研究部門 教授
DeMar Taylor 筑波大学 名誉教授
特任研究員
Nanang Rudianto Ariefta
Lee Jae Seung
中尾 勇太
Tran Thu Trang
事務室
技術補佐員 幅口 剛, 柳原 真波
事務補佐員 鹿又 由江，鈴木 希，山本 由美子
原虫病研究センター運営委員会（五十音順・敬称略）
石橋 朋子 WOAHアジア太平洋地域事務所 代表
狩野 繁之 国立国際医療研究所熱帯医学・マラリア研究部 部長
川口 寧 東京大学医科学研究所 教授
鈴木 定彦 北海道大学ワクチン研究開発拠点 特任教授
野中 成晃 北海道大学大学院獣医学研究院 教授
Badgar Battsetseg モンゴル獣医学研究所 所長
平山 謙二 長崎大学大学院熱帯医学・グローバルヘルス研究科 教授
堀井 俊宏 大阪大学微生物病研究所 教授
Hong Yeonchul 慶北大学医学部 寄生虫・熱帯医学科 教授
令和８年度 共同研究員（五十音順・敬称略）
荒木 球沙 国立感染症研究所 主任研究員
筏井 宏実 北里大学 教授
池原 譲 千葉大学 教授
石﨑 隆弘 酪農学園大学 講師
越智 章仁 日本中央競馬会 研究役
兼子 裕規 浜松医科大学 教授
川合 覚 獨協医科大学 教授
坂本 寛和 千葉大学 助教
佐藤 梢 国立感染症研究所 研究員
杉 達紀 北海道大学 助教
鈴木 丈詞 東京農工大学 教授
平良 雅克 国立感染症研究所 主任研究員
内藤 清惟 鹿児島大学 准教授
中尾 洋一 早稲田大学 教授
二瓶 浩一 微化研 上級研究員
彦坂 健児 千葉大学 准教授
藤田 秋一 鹿児島大学 教授
正谷 達謄 岐阜大学 准教授
松野 啓太 北海道大学 准教授
宮脇 慎吾 岐阜大学 准教授
村田 敏拓 東北医科薬科大学 准教授
守屋 歩 株式会社ホクドー 主任研究員
山岸 潤也 北海道大学 教授
山本 純 テキサス大学 アシスタントプロフェッサー
梁瀬 隆二 国立感染症研究所 主任研究員
吉川 泰永 北里大学 准教授
Apinya Arnuphapprasert : Rajamangala University of Technology Srivijaya, Senior Assistant Professor
Atambekova Zhyldyz : Kyrgyz Research Institute of Veterinary Named After A. Duisheev, Researcher
Atefeh Fathi : The University of Glasgow, Post doctoral
Badgar Battsetseg : Institute of Veterinary Medicine, Director
Berdikulov Atabek : Kyrgyz Research Institute of Veterinary Named After A. Duisheev, Researcher
Bernard Cheruiyot Rono : Kenya Wildlife Service, Senior Principal Veterinary Officer
Bruce Russell : University of Otago, Professor and Chair in Parasitology
Daniel Sojka : Institute of Parasitology, Biology Centre CAS, Research Scientist
Hassan Hakimi : Kansas State University, Assistant Professor
Iromy Dhananjani Amarasiri : Veterinary Research Institute, Veterinary Research Officer
Jinlin Zhou : Department of Parasitology, Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Professor
Kayhan Ilbeigi : University of Antwerp, Postdoctoral researcher
Kishor Pandey : Tribhuvan University, Associate Professor
Liqing Ma : Qinghai Academy of Animal Sciences and Veterinary Medicine, Qinghai University, Professor
Maria Cecilia Venturini : Faculty of Veterinary Sciences, La Plata National University, Head Professor・LAINPA Director-Researcher
Ruenruetai Udonsom : Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Senior professional scientist
Sanjay Kumar : ICAR-National Research Centre on Equines, India, Principal Scientist